我想杀死你。
春光明媚，注视着身着和服的你。叫住你，你有点惊讶的回过头。终于跟你说上话了。
然而你的心中藏着无法和任何人分享的秘密——那份无法抑制的破坏冲动。
这是十六岁的两仪式和黑桐干也的邂逅。
不愿和人交往的两仪式总是让干也在意，少年的心中荡漾着淡淡的恋情。两人分享相同的空间，过着平稳的日子。然而这样的生活很快就被打破了。城里连续发生了数起猎奇杀人事件。这天，干也遇到了另一个两仪式——隐藏在她心中的另一重人格“织”。
肯定的式和否定的织，同样喜欢思考却总是得出相反结论的两重人格。
一种预感在干也内心升起。究竟是谁在每夜犯罪杀人？干也想去相信自己的感觉，不去相信眼前的事实。他开始追寻真相，然而直到三年后，他才获得了答案。继承两仪家的条件、不为人知的“式”的关系、立于血泊之中的少女，不期而至的命运……空之境界第二章拉开了两仪式和干也之间的纠葛的序幕。